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NEB//E6627S/8 reactions
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NEB//E6627S/8 reactions

价格: ¥7680.00 市场价: 12800.00
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货号: E6627S-8reactions
品牌: NEB
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    • Description:

      Sample

       
       
      TheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2PanelenrichesthecompleteexoncontentofBRCA1andBRCA2genesfornext-generationse­quencinganalysis.NEBNextDirectemploysauniquehybridization-basedenrichmentworkflowthathybridizesbaitsdirectlytogenomicDNA,withouttheneedforupfrontlibrarypreparation.TheBRCA1/BRCA2paneldemonstratesextremelyhighspecificityandunmatchedcoverageuniformityacrossawiderangeofDNAinputs,allowinghighlysensitivecallingofgermlineandsomaticvariantswhilemaximizingsequencerefficiency.

      Benefits:

      • Generatefull(100%)coverageofallproteincodingregionsinBRCA1andBRCA2genes
      • Obtainhighlyuniformsequencingacrossexontargets-100%ofbasepairsinpanelhavecoveragegreaterthan20%ofthemeantargetcoverage.
      • Maximizeefficiencywitha1-dayworkflowthatcombineshighlyspecificenrichmentwithlibrarypreparation
      • ProducehighdepthsoftargetcoverageacrossawiderangeofDNAinputamountsforgermlineandsomaticvariantcalling.

      Figure1.NEBNextDirectWorkflow.
      fast hybridization workflow

      TheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2PaneldelivershighlyefficientenrichmentofBRCA1andBRCA2codingregionswithahighpercentageofreadsmappingtotargets
      Thishistogramshowsthepercentofreadsalignedtothehumangenome,andthepercentofreadsmappedtothetargetsincludedintheBRCA1/BRCA2PanelacrossdifferentinputDNAamounts.10ng,100ngand1µgofpurifiedgenomicDNAwasenrichedusingtheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panel.Sequencingreadsweregeneratedonanllumina®MiSeq®with2x75bpreads,8bpSampleIDand12bpuniquemolecularidentifier.SequencingreadalignmentswereperformedwithBWA-MEM,andPCRduplicateswerefilteredusingtheUMIs.


      TheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panelproduceshighlyuniformcoverageacrosstargetregions,maximizingsequencerefficiency
      Thishistogramshowsthenormalizedmeancoverageacrosseachofthe49exontargetsoftheBRCA1andBRCA2genes.50ngofDNAwasenrichedusingthe17kbNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panel.SequencingreadsweregeneratedonanIlluminaMiSeqwith2x75bpreads,an8bpsampleIDand12bpuniquemolecularidentifier.SequencingreadalignmentswereperformedwithBWA-MEM,andPCRduplicateswerefilteredusingtheUMIs.


      TheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2PanelcanbeusedtoprovidedepthsofsequencingcompatIBLewithbothgermlineandsomaticvariantcalling
      Thisfiguredemonstratesde-duplicatedcoverageofBRCA1andBRCA2genesasafunctionofsequencingdepthacrossarangeofinputDNAamounts.PurifiedgenomicDNAwasenrichedusingtheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panel.SequencingreadsweregeneratedonanIlluminaMiSeqwith2x75bpreads,the8bpsampleIDand12bpuniquemolecularidentifier.SequencingreadalignmentswereperformedwithBWA-MEM,andPCRduplicateswerefilteredusingtheUMIs.


      TheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panelproducesevendepthsofcoverageacrosstargetregions

      IntegrativeGenomeViewer(IGV)plotshowingthereadcoverageacrossexon1oftheBRCA1gene.50ngofDNAwasenrichedusingthe17kbNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panel.SequencingreadsweregeneratedonanIlluminaMiSeqwith2x75bpreads,an8bpsampleID,and12bpuniquemolecularidentifier.SequencingreadalignmentswereperformedwithBWA-MEM,andPCRduplicateswerefilteredusingtheUMIs.

      KitComponents

      Thefollowingreagentsaresuppliedwiththisproduct:

      Storeat(°C)Concentration
      NEBNextDirect®HybridizationAdditive-20
      NEBNextDirect®3´BluntingEnzymeMix-20
      NEBNextDirect®dA-TailingEnzyme-20
      NEBNextDirect®3´Adaptor-20
      NEBNextDirect®Ligase-20
      NEBNextDirect®5´BluntingEnzymeMix-20
      NEBNextDirect®5´UMIAdaptor-20
      NEBNextDirect®CleavingEnzymeMix-20
      NEBNextDirect®FFPEPhosphorylationEnzyme-20
      NEBNextDirect®BeadWash125
      NEBNextSamplePurificationBeads25
      NEBNextDirect®StreptavidinBeads4
      NEBNextDirect®HybridizationWash(HW)4
      NEBNextDirect®BeadPrepBuffer4
      NEBNextDirect®HybridizationBuffer4
      NEBNextDirect®dA-TailingBuffer4
      NEBNextDirect®AdaptorLigationBuffer4
      NEBNextDirect®5´BluntingBuffer4
      NEBNextDirect®CleavingBuffer4
      NEBNextDirect®BeadWash24
      NEBNextDirect®Q5MasterMix-20
      NEBNextDirectBRCA1/BRCA2Baits-20
    售后保障
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